Title | 两毒性预测软件应用于中药成分毒性预测的验证分析 |
Authors | 史少泽 王旗 |
Affiliation | 北京大学公共卫生学院毒理学系 |
Keywords | 定量构效关系 分子对接 中药 化学成分 毒性预测 |
Issue Date | 2016 |
Publisher | 中国新药杂志 |
Citation | 中国新药杂志.2016,25(23),2647-2652. |
Abstract | 目的: 计算机预测为中药毒性成分发现提供了简单快速的初步筛选工具。而现有预测软件原理有两类,一类是基于合成药物开发的定量构效关系(QSAR)模型;另一类是基于分子对接预测毒性。而天然产物与合成药物结构上有所不同,因此现有软件是否适用于中药成分预测需要验证。 方法: ADMET Predictor与VirtualToxLab分别是基于QSAR与分子对接开发的毒性预测软件。通过查阅PubMed、中国中药成分数据库、Toxnet,收集中药成分毒性数据,验证两软件中肝毒性、急性毒性、雌激素受体作用以及CYP抑制模型。根据文献方法与灵敏度、特异度、约登指数、马修斯相关系数来评价两软件。 结果: ADMET Predictor预测急性毒性符合文献中评价QSAR模型的标准;肝毒性的约登指数,马修斯相关系数分别为0.58和0.58;雌激素受体作用灵敏度为67%,对CYP1A2,2C9,2D6,3A4抑制的约登指数分别为0.11,0.42,0.80,0.09,马修斯相关系数分别为0.16,0.57,0.78,0.11。VirtualToxLab预测雌激素受体作用灵敏度为91%,对CYP1A2,2C9,2D6,3A4的约登指数分别为0.61,0.46,0.68,0.55,马修斯相关系数分别为0.62,0.55,0.70,0.57。 结论: ADMET Predictor与VirtualToxLab均可应用于中药成分预测,其中雌激素受体作用以及CYP抑制,VirtualToxLab表现优于ADMET Predictor。 |
URI | http://hdl.handle.net/20.500.11897/478221 |
Indexed | 中文核心期刊要目总览(PKU) 中国科技核心期刊(ISTIC) 中国科学引文数据库(CSCD) |
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